El cliente dice que el pedido estaba en tarjeta

Tu como repartidor siempre debes guiarte por lo que tu aplicación te dice. 

Si dice que debes cobrar porque el valor está en EFECTIVO, es porque eso es lo que debes hacer. Si dice que no cobres porque el pago está en TARJETA entonces no cobras. 

Pueden haber casos en que el cliente esté confundido o no haya revisado bien su método de pago. Le pides amablemente que revise en su app y si no lo pueden solucionar, puedes comunicarte con soporte para que te revisen en el momento y te den una solución.